DBatVir: база даних вірусів, пов'язаних з Bat

ПРО

Кажани є одним з найбільш успішних ссавців і, ймовірно, найбільш різноманітні. Більше 1200 видів кажанів забезпечують безпрецедентну виставку варіацій на тему ссавців і широкий урок з біології. Крім того, останніми роками кажани здобули значну популярність за те, що вони були залучені до численних інфекційних захворювань, включаючи спалах ТОРС десять років тому, і в даний час MERS (Близький Східний респіраторний синдром) ендемічний на Близькому Сході.
Насправді, кажанам вважають, що вони є важливими господарями багатьох зоонозних вірусів, які можуть перетинати види бар'єрів для інфікування людей та інших домашніх або диких ссавців, включаючи лісавіруси, геніпавіруси, еболавіруси, марбургвіруси та коронавіруси. Їхня здатність літати і історія соціального життя дозволяють ефективно підтримувати патоген, еволюцію і поширення. Віруси кажанів можуть передаватися людям безпосередньо через укуси або через вплив слини, фекальних аерозолів або інфікованих тканин, а також опосередковано через контакт із інфікованими проміжними господарями, наприклад свинями. Тому вивчення вірусів, пов'язаних з рукокрилих, та їх потенціалу, що розвивається, вважається все більш важливим. Дуже важливо підвищити наші знання та розуміння високого біорізноманіття кажанів, широкого географічного розповсюдження та генетичного різноманіття вірусів, пов'язаних з рукокрилих, для сприяння поточній та майбутній запобіганню зоонозних захворювань, відстеженню джерел та прогнозуванню.
В останні роки методології секвенування наступного покоління були використані в ряді метагеномних досліджень, присвячених оцінці вирусу кажанів, і ці дослідження виявили багато відомих і нових вірусів у зразках кажанів. Однак найцінніша інформація, така як час відбору проб, місце розташування, вид кажанів і тип зразка, доступна лише спорадично у відповідній літературі або окремому записі послідовності. Отримання повної інформації про віруси, пов'язані з рукокрилих, стає величезним завданням.
Таким чином, була створена база даних вірусів, пов'язаних з рукокрилих (DBatVir), щоб полегшити подальші дослідження, надаючи науковій спільноті всеосяжну, сучасну та добре керовану інформацію. Завдяки зручному для користувача інтерфейсу та онлайновим аналітичним інструментам DBatVir присвячується, щоб служити цінною платформою, яка не тільки корисна для вірусологів, які хочуть краще зрозуміти різноманітність витів, але й бути корисними для зоологів, які займаються здоров'ям домашніх і диких тварин. тварин. Крім того, ця платформа є особливо цінною для епідеміологів і дослідників охорони здоров'я, оскільки вона є корисною для моніторингу та відстеження поточних та майбутніх інфекційних захворювань, пов'язаних з рукокрилих.
Молекулярні методи зараз широко використовуються в діагностиці та функціональному аналізі вірусів; таким чином, DBatVir будується як база даних, орієнтована на послідовність. База даних DBatVir в даний час оновлюється раз на два місяці, щоб надати огляд і знімок поточних досліджень щодо вірусів ANIMAL, пов'язаних з битою, що є важливим зараз, коли поле швидко розширюється.

UPDATE

• Оновлення даних липня 2019 (317 послідовностей).
• Оновлення даних травня 2019 (170 послідовностей).
• Оновлення даних Mar, 2019 (1532 послідовності).
• Оновлення даних січня 2019 (147 послідовностей).
• Оновлення даних за листопад 2018 (450 послідовностей).
• Оновлення даних за Sep, 2018 (174 послідовності).
• Оновлення даних липня 2018 р. (187 послідовностей).
• Оновлення даних травня 2018 року (453 послідовності).
• Оновлення даних від Mar, 2018 (183 послідовності).
• Оновлення даних січня 2018 (1339 послідовностей).
• Оновлення даних за листопад 2017 року (28 послідовностей).
• Оновлення даних за вересень 2017 року (109 послідовностей).
• Оновлення даних липня 2017 року (247 послідовностей).
• Оновлення даних за травень 2017 року (260 послідовностей).
• Оновлення даних за квітень 2017 року (91 послідовність).
• Оновлення даних за березень 2017 року (414 послідовностей).
• Оновлення даних за лютий 2017 року (283 послідовності).
• Оновлення даних за грудень 2016 року (23 послідовності).
• Оновлення даних за листопад 2016 року (50 послідовностей).
• Оновлення даних за жовтень 2016 року (34 послідовності).
• Оновлення даних за вересень 2016 року (64 послідовності).
• Оновлення даних від серпня 2016 року (120 послідовностей).
• Оновлення даних липня 2016 року (34 послідовності).
• Оновлення даних червня 2016 року (147 послідовностей).
• Оновлення даних за травень 2016 року (61 послідовність).
• Оновлення даних квітня 2016 року (135 послідовностей).
• Оновлення даних за лютий 2016 року (48 послідовностей).
• Оновлення даних за січень 2016 року (102 послідовності).
• Оновлення даних за грудень 2015 року (53 послідовності).
• Оновлення даних за листопад 2015 року (271 послідовність).
• Оновлення даних у вересні 2015 року (258 послідовностей).
• Оновлення даних липня 2015 року (24 послідовності).
• Оновлення даних за червень 2015 року (64 послідовності).
• Оновлення даних травня 2015 року (173 послідовності).
• Оновлення даних за квітень 2015 року (11 послідовностей).
• Оновлення даних за березень 2015 року (48 послідовностей).
• Оновлення даних за лютий 2015 року (68 послідовностей).
• Оновлення даних за січень 2015 року (161 послідовність).
• Оновлення даних за грудень 2014 року (159 послідовностей).
• Оновлення даних за листопад 2014 року (79 послідовностей).
• Оновлення даних за жовтень 2014 року (25 послідовностей).
• Оновлення даних за вересень 2014 року (169 послідовностей).
• Оновлення даних липня 2014 року (86 послідовностей).

ПУБЛІКАЦІЯ

Chen L, Лю B, Ян J, Jin Q, 2014. DBatVir: база даних вірусів, пов'язаних з рукокрилих. Database (Оксфорд) . 2014: bau021. doi: 10.1093 / database / bau021

КОНТАКТИ

База даних DBatVir має на меті об'єднати вірусологічні, екологічні та епідеміологічні дані, щоб підвищити наші знання про кажанів як про важливих господарях багатьох зоонозних вірусів, що мають значний вплив на здоров'я людини і тварин. Інформація була зібрана вручну з опублікованих літератур і записів у базі даних GenBank. Однак пов'язані метадані деяких послідовностей, такі як час відбору проб, місце розташування, види кажанів, тип зразка і т.д., відсутні в даний час. Тому ми вдячні оригінальним авторам, які допомагають нам заповнити або виправити відповідну інформацію, зібрану в базі даних, надіславши зворотний зв'язок Доктор Цзян Янг .

ПОДЯКА

Ця робота була підтримана Національним проектом і програмою з основних наукових і технологічних питань для науковців Янцзян та Інноваційної дослідницької групи в Університеті Китаю. Ми хотіли б подякувати ViralZone за надання нам чудових зображень віріонів.